シロイヌナズナのコドン使用頻度表

アミノ酸は一文字表記で記した。なお、終止コドンはアミノ酸をコードしないため、コードするアミノ酸の一文字表記の代わりに*で示した。

評価指数

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#lang	en
#attribution_name	Masahiro Mochizuki
#license	http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/deed.ja
#file_name	codon_table_of_Arabidopsis_thaliana
#download_from	http://linkdata.org/work/rdf1s291i
#property	one-letter code of amino acid	usage
#object_type_xsd	string:en	float
#property_context	Assertion	Assertion
AAA	K	0.49
AAC	N	0.48
AAG	K	0.51
AAT	N	0.52
ACA	T	0.31
ACC	T	0.2
ACG	T	0.15
ACT	T	0.34
AGA	R	0.35
AGC	S	0.13
AGG	R	0.2
AGT	S	0.16
ATA	I	0.24
ATC	I	0.35
ATG	M	1
ATT	I	0.41
CAA	Q	0.56
CAC	H	0.39
CAG	Q	0.44
CAT	H	0.61
CCA	P	0.33
CCC	P	0.11
CCG	P	0.18
CCT	P	0.38
CGA	R	0.12
CGC	R	0.07
CGG	R	0.09
CGT	R	0.17
CTA	L	0.11
CTC	L	0.17
CTG	L	0.11
CTT	L	0.26
GAA	E	0.52
GAC	D	0.32
GAG	E	0.48
GAT	D	0.68
GCA	A	0.27
GCC	A	0.16
GCG	A	0.14
GCT	A	0.43
GGA	G	0.37
GGC	G	0.14
GGG	G	0.16
GGT	G	0.34
GTA	V	0.15
GTC	V	0.19
GTG	V	0.26
GTT	V	0.4
TAA	*	0.36
TAC	Y	0.48
TAG	*	0.2
TAT	Y	0.52
TCA	S	0.2
TCC	S	0.13
TCG	S	0.1
TCT	S	0.28
TGA	*	0.44
TGC	C	0.4
TGG	W	1
TGT	C	0.6
TTA	L	0.14
TTC	F	0.49
TTG	L	0.22
TTT	F	0.51

※ 100行まで表示しています。

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