PromoterCAD

AtGenExpress gene expression + PLACE promoter motif Triplicate Data

Full triplicate expression dataset of AtGenExpress plant developmental tissues, combined with PLACE (Plant Cis-acting Regulatory DNA Elements) motif database. MotifExpress tool allows the plloting of all triplicate data points during the design process, so the user has some idea of the experimental variation in the measurements.

References (for PLACE)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9847208
References (for AtGenExpress)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15806101

Descriptions for each data table:

AtGenExpress_PLACE_Flowering	This collection of Gene Expression Properties are associated with flowering tissues.
AtGenExpress_PLACE_Fruit_Seeds	This collection of Gene Expression Properties are associated with fruit and seed tissues.
AtGenExpress_PLACE_Leaf	This collection of Gene Expression Properties are associated with leaf tissues.
AtGenExpress_PLACE_Root	This collection of Gene Expression Properties are associated with root tissues.
AtGenExpress_PLACE_Seedling	This collection of Gene Expression Properties are associated with seedling tissues.
AtGenExpress_PLACE_Stem	This collection of Gene Expression Properties are associated with stem tissues.
AtGenExpress_PLACE_Whole_Plant	This collection of Gene Expression Properties are associated with whole plant body parts.

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ファイル名
AtGenExpress_PLACE_Flowering			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.24	19.2MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.24	32.1MB
RDF (Turtle)	2013.4.24	89.9MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_PLACE_Fruit_Seeds			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.29	8.3MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.29	13.3MB
RDF (Turtle)	2013.4.29	34.7MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_PLACE_Leaf			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.24	12.1MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.24	19.9MB
RDF (Turtle)	2013.4.24	54.0MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_PLACE_Root			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.24	7.4MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.24	11.7MB
RDF (Turtle)	2013.4.24	30.6MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_PLACE_Seedling			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.24	10.2MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.24	16.6MB
RDF (Turtle)	2013.4.24	44.6MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_PLACE_Stem			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.24	6.0MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.24	9.2MB
RDF (Turtle)	2013.4.24	23.4MB
		その他の形式のAPIリストを表示
AtGenExpress_PLACE_Whole_Plant			Action テーブルデータの内容を見る APIリストを表示する地図を表示する RDFをチェックするテーブルデータの再利用
テーブルデータ (テキスト)	2013.4.24	6.0MB
テーブルデータ (Excel)	2013.4.24	9.2MB
RDF (Turtle)	2013.4.24	23.4MB
		その他の形式のAPIリストを表示

このデータセットをWebで検索

投稿者メッセージ送信	Koro_Nishikata
共同編集者	Robert Cox
関連するWebサイト	http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/ http://arabidopsis.org/servlets/TairOb...
データのリファレンス	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/984... http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/158...
合計ダウンロード数	1486回
最初に登録した日	2013年4月24日
最後に更新した日	2013年5月1日

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