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Developmental Genomic (AtGenExpress + PPDB promoter motif) normalized

Normalized Expression Data of AtGenExpress plant developmental tissues, combined with LDSS sequence analysis of regulatory (8mer) motif calculations (PPDB).

References (for PPDB):
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17947329
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17346352
References (for AtGenExpress)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15806101


Descriptions for each data table:
AtGenExpress_PPDB_Flowering_normalize This collection of Gene Expression Properties are associated with flowering tissues.
AtGenExpress_PPDB_Fruit_Seeds_normalize
This collection of Gene Expression Properties are associated with fruit and seed tissues.
AtGenExpress_PPDB_Leaf_normalize
This collection of Gene Expression Properties are associated with leaf tissues.
AtGenExpress_PPDB_Root_normalize
This collection of Gene Expression Properties are associated with root tissues.
AtGenExpress_PPDB_Seedling_normalize
This collection of Gene Expression Properties are associated with seedling tissues.
AtGenExpress_PPDB_Stem_normalize
This collection of Gene Expression Properties are associated with stem tissues.
AtGenExpress_PPDB_Whole_Plant_normalize
This collection of Gene Expression Properties are associated with whole plant body parts.


License

We would like to thank Dr. Yoshiharu Yamamoto for supplying the data of PPDB (Plant Promoter Database) for PromoterCAD & GenoCon2 competition. License of this work's data is according to the intentions of the PPDB original data source.
http://ppdb.agr.gifu-u.ac.jp/ppdb/cgi-bin/license.cgi

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ファイル名
AtGenExpress_PPDB_Flowering_normalize
テーブルデータ (テキスト)
2013.5.10
8.7MB
テーブルデータ (Excel)
2013.5.10
14.7MB
RDF (Turtle)
2013.5.10
38.8MB
AtGenExpress_PPDB_Fruit_Seeds_normalize
テーブルデータ (テキスト)
2013.5.10
4.6MB
テーブルデータ (Excel)
2013.5.10
7.0MB
RDF (Turtle)
2013.5.10
15.4MB
AtGenExpress_PPDB_Leaf_normalize
テーブルデータ (テキスト)
2013.5.10
6.0MB
テーブルデータ (Excel)
2013.5.10
9.6MB
RDF (Turtle)
2013.5.10
23.6MB
AtGenExpress_PPDB_Root_normalize
テーブルデータ (テキスト)
2013.5.10
4.2MB
テーブルデータ (Excel)
2013.5.10
6.2MB
RDF (Turtle)
2013.5.10
13.7MB
AtGenExpress_PPDB_Seedling_normalize
テーブルデータ (テキスト)
2013.5.10
5.3MB
テーブルデータ (Excel)
2013.5.10
8.3MB
RDF (Turtle)
2013.5.10
19.6MB
AtGenExpress_PPDB_Stem_normalize
テーブルデータ (テキスト)
2013.5.10
3.7MB
テーブルデータ (Excel)
2013.5.10
5.2MB
RDF (Turtle)
2013.5.10
10.6MB
AtGenExpress_PPDB_Whole_Plant_normalize
テーブルデータ (テキスト)
2013.5.10
3.7MB
テーブルデータ (Excel)
2013.5.10
5.1MB
RDF (Turtle)
2013.5.10
10.6MB
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最初に登録した日 2013年3月5日
最後に更新した日 2013年5月10日

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